Ce que dit Wikipédia (
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Dans un aquarium, les déjections des poissons et la nourriture non consommée sont à l'origine de la formation d'ammoniac, un produit extrêmement toxique pour les animaux aquatiques. Une suite de transformations biochimiques - dans lesquelles interviennent des bactéries - vont transformer l'ammoniac en nitrites très toxiques, puis en nitrates beaucoup moins toxiques et bénéfiques aux plantes.
Une première population de bactéries (les nitrosomonas) va transformer l'ammoniac en nitrites, eux-mêmes encore très toxiques pour les animaux aquatiques. Une deuxième population de bactéries (les nitrobacter) va ensuite apparaître, qui elle va transformer les nitrites en nitrates. Les nitrates sont alors absorbées par les plantes présentes dans l'aquarium.
Ces bactéries sont absentes de l'eau utilisée pour remplir l'aquarium. Les populations de bactéries vont apparaître progressivement à partir du moment où l'aquarium est rempli, le lancement du cycle nécessite environ 3 semaines. L'accumulation d'ammoniac va provoquer la prolifération de la première population de bactérie. Ces bactéries vont transformer l'ammoniac en nitrites. Au bout de quelques jours l'accumulation de nitrites, dû à la première population de bactéries va provoquer la prolifération de la deuxième population de bactéries, qui va faire retomber la concentration de nitrites. La concentration de nitrites redescend jusqu'à être totalement indétectable, à partir de ce moment l'aquarium est sain pour les poissons.
La plupart des aquariums ont un excédent de poissons, et pas assez de plantes par rapport à la quantité de nitrates produites. Les nitrates finissent par s'accumuler dans l'eau, et il est alors nécessaire de les diluer régulièrement au bout de une à deux semaines en remplaçant une part de l'eau de l'aquarium par de l'eau "neuve". La fréquence des remplacements dépendra de la sensibilité des animaux. De nombreux poissons supportent des concentrations jusqu'à 50 mg/l. Par contre, les coraux “durs“ ne supportent pas des concentrations supérieures à 2 mg/l.
Les bactéries dégradant l'ammoniac et les nitrites sont présentes dans l'eau, le sol de l'aquarium et le filtre. Le brassage provoqué par le filtre et la pompe amène l'eau riche en oxygène de la surface vers le fond, et assure la survie des bactéries - qui ont besoin d'oxygène pour vivre -, il sert également à mettre en contact les bactéries présentes dans le filtre avec l'eau de l'aquarium.
À partir du moment où le cycle de l'azote est en route, on dit que l'aquarium est cyclé: L'ammoniac et les nitrites qui se forment dans l'eau sont immédiatement transformés, et les concentrations restent à des niveaux indétectables.